Publications

Epidemiology and Demography

Molecular Analysis of Human Respiratory Syncytial Virus Group B Strains Isolated in Kenya Before and During the Emergence of Pandemic Influenza A/H1N1.Wangui, J. Gachara, G. Mobegi, V. Agoti, C. Otieno, J. Opanda, S. Opot, B. Ngeranwa, J. N. Njeru, R. Bulimo, W.
Influenza Other Respir Viruses, (2025). 19:e70082

Prevalence and Predictors of Adverse Birth Outcomes and Their Implications in Assessing the Safety of New Maternal Vaccines in Kenya.Nyiro, J. U. Bukusi, E. Mureithi, M. W. Walumbe, D. Nyaguara, A. Kipkoech, C. Nyawanda, B. Bigogo, G. Otieno, N. Aol, G. Audi, A. Murunga, N. Berkley, J. A. Nokes, D. J. Munywoki, P. K.
Pediatr Infect Dis J, (2025). 44:S114-S118

Characterising the asynchronous resurgence of common respiratory viruses following the COVID-19 pandemic.Zhao, C. Zhang, T. Guo, L. Sun, S. Miao, Y. Yung, C. F. Tomlinson, J. Stolyarov, K. Shchomak, Z. Poovorawan, Y. Nokes, D. J. Munoz-Almagro, C. Mandelboim, M. Keck, J. W. Langley, J. M. Heikkinen, T. Deng, J. Colson, P. Chakhunashvili, G. Caballero, M. T. Bont, L. Feikin, D. R. Nair, H. Wang, X. Li, Y. Respiratory Virus Global Epidemiology, Network
Nat Commun, (2025). 16:1610

Global impact of 10- and 13-valent pneumococcal conjugate vaccines on pneumococcal meningitis in all ages: The PSERENADE project.Yang, Y. Knoll, M. D. Herbert, C. Bennett, J. C. Feikin, D. R. Garcia Quesada, M. Hetrich, M. K. Zeger, S. L. Kagucia, E. W. Xiao, M. Cohen, A. L. van der Linden, M. du Plessis, M. Yildirim, I. Winje, B. A. Varon, E. Valenzuela, M. T. Valentiner-Branth, P. Steens, A. Scott, J. A. Savrasova, L. Sanz, J. C. Khan, A. S. Oishi, K. Nzoyikorera, N. Nuorti, J. P. Mereckiene, J. McMahon, K. McGeer, A. Mackenzie, G. A. MacDonald, L. Ladhani, S. N. Kristinsson, K. G. Kleynhans, J. Kellner, J. D. Jayasinghe, S. Ho, P. L. Hilty, M. Hammitt, L. L. Guevara, M. Gilkison, C. Gierke, R. Desmet, S. De Wals, P. Dagan, R. Colzani, E. Ciruela, P. Chuluunbat, U. Chan, G. Camilli, R. Bruce, M. G. Brandileone, M. C. Ampofo, K. O'Brien, K. L. Hayford, K. Pserenade Team
J Infect, (2025). 90:106426

Effect of mass campaigns with full and fractional doses of pneumococcal conjugate vaccine (Pneumosil) on the reduction of nasopharyngeal pneumococcal carriage in Niger: a three-arm, open-label, cluster-randomised trial.Coldiron, M. E. Soumana, I. Baudin, E. Langendorf, C. Mamiafo Tchoula, C. Brah, S. Karani, A. Gallagher, K. E. Kagucia, E. W. Scott, J. A. G. Grais, R. F.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:634-642

Malaria prophylaxis in sickle cell anaemia: some answers, more questions.Williams, T. N. Ware, R. E.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:601-602

Serotype distribution of remaining invasive pneumococcal disease after extensive use of ten-valent and 13-valent pneumococcal conjugate vaccines (the PSERENADE project): a global surveillance analysis.Garcia Quesada, M. Peterson, M. E. Bennett, J. C. Hayford, K. Zeger, S. L. Yang, Y. Hetrich, M. K. Feikin, D. R. Cohen, A. L. von Gottberg, A. van der Linden, M. van Sorge, N. M. de Oliveira, L. H. de Miguel, S. Yildirim, I. Vestrheim, D. F. Verani, J. R. Varon, E. Valentiner-Branth, P. Tzanakaki, G. Sinkovec Zorko, N. Setchanova, L. P. Serhan, F. Scott, K. J. Scott, J. A. Savulescu, C. Savrasova, L. Reyburn, R. Oishi, K. Nuorti, J. P. Napoli, D. Mwenda, J. M. Munoz-Almagro, C. Morfeldt, E. McMahon, K. McGeer, A. Mad'arova, L. Mackenzie, G. A. Eugenia Leon, M. Ladhani, S. N. Kristinsson, K. G. Kozakova, J. Kleynhans, J. Klein, N. P. Kellner, J. D. Jayasinghe, S. Ho, P. L. Hilty, M. Harker-Jones, M. A. Hammitt, L. L. Grgic-Vitek, M. Gilkison, C. Gierke, R. French, N. Diawara, I. Desmet, S. De Wals, P. Dalby, T. Dagan, R. Corcoran, M. Colzani, E. Chanto Chacon, G. Castilla, J. Camilli, R. Ang, M. Ampofo, K. Almeida, S. C. G. Alarcon, P. O'Brien, K. L. Deloria Knoll, M. Pserenade Team
Lancet Infect Dis, (2025). 25:445-456

Global impact of ten-valent and 13-valent pneumococcal conjugate vaccines on invasive pneumococcal disease in all ages (the PSERENADE project): a global surveillance analysis.Bennett, J. C. Deloria Knoll, M. Kagucia, E. W. Garcia Quesada, M. Zeger, S. L. Hetrich, M. K. Yang, Y. Herbert, C. Ogyu, A. Cohen, A. L. Yildirim, I. Winje, B. A. von Gottberg, A. Viriot, D. van der Linden, M. Valentiner-Branth, P. Suga, S. Steens, A. Skoczynska, A. Sinkovec Zorko, N. Scott, J. A. Savulescu, C. Savrasova, L. Sanz, J. C. Russell, F. Ricketson, L. J. Puentes, R. Nuorti, J. P. Mereckiene, J. McMahon, K. McGeer, A. Mad'arova, L. Mackenzie, G. A. MacDonald, L. Lepp, T. Ladhani, S. N. Kristinsson, K. G. Kozakova, J. Klein, N. P. Jayasinghe, S. Ho, P. L. Hilty, M. Heyderman, R. S. Hasanuzzaman, M. Hammitt, L. L. Guevara, M. Grgic-Vitek, M. Gierke, R. Georgakopoulou, T. Galloway, Y. Diawara, I. Desmet, S. De Wals, P. Dagan, R. Colzani, E. Cohen, C. Ciruela, P. Chuluunbat, U. Chan, G. Camilli, R. Bruce, M. G. Brandileone, M. C. Bigogo, G. Ampofo, K. O'Brien, K. L. Feikin, D. R. Hayford, K. Pserenade Team
Lancet Infect Dis, (2025). 25:457-470

Infections in sickle cell disease.Scourfield, L. E. A. Nardo-Marino, A. Williams, T. N. Rees, D. C.
Haematologica, (2025). 110:546-561

Relation Between the Dantu Blood Group Variant and Bacteremia in Kenyan Children: A Population-Based Case-Control Study.Kariuki, S. N. Gilchrist, J. J. Uyoga, S. Macharia, A. Makale, J. Rayner, J. C. Williams, T. N.
J Infect Dis, (2025). 231:e10-e16

Comparative performance of the InBios SCoV-2 Detect (TM) IgG ELISA and the in-house KWTRP ELISA in detecting SARS-CoV-2 spike IgG antibodies in Kenyan populations.Kutima, B. Kagucia, E. W. Mwai, K. Kimani, M. Sigilai, A. Mugo, D. Karanja, H. Gitonga, J. N. Karani, A. Akech, D. Toroitich, M. Karia, B. Tuju, J. Ziraba, A. K. Bigogo, G. Ochieng, C. Onyango, C. Lidechi, S. Munywoki, P. K. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Oyier, L. I. O. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Nyagwange, J. Kenya, Sars-CoV-Serology Consortium
Wellcome Open Res, (2024). 9:349

Evaluation of population immunity against SARS-CoV-2 variants, EG.5.1, FY.4, BA.2.86, JN.1, JN.1.4, and KP.3.1.1 using samples from two health demographic surveillance systems in Kenya.Lugano, D. Kutima, B. Kimani, M. Sigilai, A. Gitonga, J. Karani, A. Akech, D. Karia, B. Ziraba, A. K. Maina, A. Lambisia, A. Omuoyo, D. Mugo, D. Lucinde, R. Owuor, S. Konyino, G. Newman, J. Bailey, D. Nduati, E. Githinji, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Kagucia, W. Warimwe, G. M. Sande, C. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
BMC Infect Dis, (2024). 24:1474

Breastfeeding mothers in DR Congo should have access to the mpox vaccine.Hombach, J. Lewis, R. Holten, J. V. Scott, J. A. Neuzil, K. M.
Lancet Glob Health, (2024). 12:e1932

Azithromycin in severe malaria bacterial co-infection in African children (TABS-PKPD): a phase II randomised controlled trial.Connon, R. Olupot-Olupot, P. Pistorius, A. M. A. Okiror, W. Ssenyondo, T. Muhindo, R. Uyoga, S. Mpoya, A. Williams, T. N. Gibb, D. M. Walker, A. S. Ter Heine, R. George, E. C. Maitland, K.
BMC Med, (2024). 22:516

Prospective clinical surveillance for severe acute respiratory illness and COVID-19 vaccine effectiveness in Kenyan hospitals during the COVID-19 pandemic.Lucinde, R. K. Gathuri, H. Isaaka, L. Ogero, M. Mumelo, L. Kimego, D. Mbevi, G. Wanyama, C. Otieno, E. O. Mwakio, S. Saisi, M. Isinde, E. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Giabe, M. Omondi, C. Aman, R. Amoth, P. Kasera, K. Were, F. Nganga, W. Berkley, J. A. Tsofa, B. Mwangangi, J. Bejon, P. Barasa, E. English, M. Scott, J. A. G. Akech, S. Kagucia, E. W. Agweyu, A. Etyang, A. O.
BMC Infect Dis, (2024). 24:1246

Recommendations for Using Health Service Coverage Cascades to Measure Effective Coverage for Maternal, Newborn, Child, and Adolescent Health Services or Interventions.Strong, K. Konstantinou, G. Agweyu, A. Diaz, T. Jackson, D. Kim, M. Kubota, S. Leslie, H. Lazzerini, M. Marchant, T. Munos, M. Muzigaba, M. Quach, A. Sheffel, A. Yaqub, N, Jr. Life Stages Quality of Care Metrics Technical Working Group for Maternal, Newborn Child Adolescent, Health Ageing,
Glob Health Sci Pract, (2024). 12:

Inno4Vac Workshop Report Part 2: RSV-Controlled Human Infection Model (CHIM) Strain Selection and Immune Assays for RSV CHIM Studies, November 2021, MHRA, UK.Waldock, J. Cox, R. J. Engelhardt, O. G. Ascough, S. Osterhaus, A. Rimmelzwaan, G. F. Ludlow, M. Tregoning, J. S. McDonald, J. U. Buchholz, U. J. Jeeninga, R. E. Sande, C. Chiu, C.
Influenza Other Respir Viruses, (2024). 18:e70013

Inpatient and postdischarge mortality among children with anaemia and malaria parasitaemia in Kenya: a cohort study.Ngari, M. Mwangome, M. Ouma, N. Nyaguara, A. Mturi, N. Obiero, C. Kamau, A. Walson, J. L. Iversen, P. O. Maitland, K. Snow, R. W. Berkley, J.
BMJ Glob Health, (2024). 9:

Local patterns of spread of influenza A H3N2 virus in coastal Kenya over a 1-year period revealed through virus sequence data.Owuor, D. C. Ngoi, J. M. Nyasimi, F. M. Murunga, N. Nyiro, J. U. Chaves, S. S. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Sci Rep, (2024). 14:23426

Is fat mass a better predictor of 6-month survival than muscle mass among African children aged 6-59 months with severe pneumonia?.Nalwanga, D. Musiime, V. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Alaroker, F. Opoka, R. Tagoola, A. Mnjalla, H. Mogaka, C. Nabawanuka, E. Giallongo, E. Karamagi, C. Briend, A. Maitland, K.
BMC Nutr, (2024). 10:130